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1.Identification of novel mutations in Japanese ovarian clear cell carcinoma patients using optimized targeted NGS for clinical diagnosis

作者：Yoshiaki Maru^a ; ^b ; Naotake Tanaka^c ; Miki Ohira^d ; Makiko Itami^e ; Yoshitaka Hippo^a ; Hiroki Nagase^b ; ^f ; ^{hnagase@chiba-cc.jp}

关键词：Somatic mutations ; Next-generation sequencing ; Clinical sequencing ; FFPE ; Ovarian clear cell carcinoma

刊名：Gynecologic Oncology

出版年：2017

2.Quantification of telomere features in tumor tissue sections by an automated 3D imaging-based workflow

作者：Manuel Gunkel^a ; ¹ ; Inn Chung^b ; ¹ ; ^{i.chung@dkfz.de} ; Stefan Wö ; rz^c ; ¹ ; Katharina I. Deeg^b ; Ronald Simon^d ; Guido Sauter^d ; David T.W. Jones^e ; Andrey Korshunov^f ; Karl Rohr^c ; ^{k.rohr@dkfz.de} ; Holger Erfle^a ; ^{holger.erfle@bioquant.uni-heidelberg.de} ; Karsten Rippe^b ; ^{karsten.rippe@dkfz.de}

关键词：3D-TIM ; 3D Targeted Imaging ; ALT ; alternative lengthening of telomeres ; APB ; ALT-associated PML-NB ; CLSM ; confocal laser scanning fluorescence microscopy ; ECTR ; extrachromosomal telomeric repeat ; FFPE ; formalin-fixed ; paraffin-embedded ; FISH ; fluorescence in situ hybridization ; IF ; immunofluorescence ; pedGBM ; pediatric glioblastoma ; PML ; promyelocytic leukemia ; PML-NB ; PML nuclear body ; PNA ; peptide nucleic acid ; ROI ; region of interest ; TMA ; tissue microarray ; TMM ; telomere maintenance mechanis

刊名：Methods

出版年：2017

3.Proteomic investigation of human cystic echinococcosis in the liver

作者：Ré ; mi Longuespé ; e^a ; ^b ; ^{remi.longuespee@med.uni-heidelberg.de} ; Rita Casadonte^a ; Mark Kriegsmann^b ; Petra Wandernoth^c ; Katharina Lisenko^d ; Gabriel Mazzucchelli^e ; Michael Becker^f ; Jö ; rg Kriegsmann^a ; ^c ; ^g

关键词：ACN ; Acetronitrile ; CA ; Citric acid ; CE ; Cystic echinococcosis ; Eg ; Echinococcus granulosus ; ECM ; Extra cellular matrix ; FFPE ; Formalin fixed paraffin embedded ; fr/fr ; Fresh/frozen ; GO ; Gene ontology ; HIAR ; Heat-induced antigen retrieval ; HIV ; Human immunodeficiency virus ; HLA ; Human leucocyte antigen ; IMS ; Imaging mass spectrometry ; LMD ; Laser microdissection ; LC&ndash ; MS/MS ; Liquid chromatography-mass spectrometry/mass spectrometry ; MALDI ; Matrix-assisted laser desorption-ionization ; PAS ; Peri

刊名：Molecular and Biochemical Parasitology

出版年：2017

4.Development and validation of an immunohistochemistry procedure for the detection of a neurotropic bovine astrovirus

作者：Cé ; line L. Boujon^a ; ^{celine.boujon@vetsuisse.unibe.ch} ; Senija Selimovic-Hamza^a ; ^b ; ^{senija.selimovic@vetsuisse.unibe.ch} ; Ilias Bouzalas^a ; ^{ilias.bouzalas@vetsuisse.unibe.ch} ; Torsten Seuberlich^a ; ^{torsten.seuberlich@vetsuisse.unibe.ch}

关键词：BoAstV ; bovine astrovirus ; ESBE ; European sporadic bovine encephalitis ; FFPE ; formalin-fixed ; paraffin embedded ; NGS ; next-generation sequencing ; IHC ; immunohistochemistry ; IPTG ; isopropyl-β-d-thiogalactopyranoside ; ISH ; in situ hybridization ; IF ; immunofluorescence ; ORF ; open reading frame ; RT-PCR ; reverse transcription PCR

刊名：Journal of Virological Methods

出版年：2017

5.Downregulation of DNA methyltransferase 3 alpha promotes cell proliferation and invasion of ectopic endometrial stromal cells in adenomyosis

作者：Yang Zou^a ; ^b ; ¹ ; Fa-Ying Liu^a ; ^b ; ¹ ; Li-Qun Wang^a ; ^c ; Jiu-Bai Guo^a ; ^c ; Bi-Cheng Yang^a ; Xi-Di Wan^a ; Feng Wang^a ; ^b ; Ming He^d ; ^{jxhm56@hotmail.com} ; Ou-Ping Huang^a ; ^c ; ^{jxfbhop@126.com}

关键词：DNMT3A ; DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A ; EECs ; endometrial epithelial cells ; ESCs ; endometrial stromal cells ; EEECs ; ectopic endometrial epithelial cells ; WB ; Western blotting ; IHC ; immunohistochemistry ; ACTB ; beta-actin ; FFPE ; formalin fixed paraffin embedded ; CCK-8 ; Cell Counting Kit-8 ; OD ; optical density

刊名：Gene

出版年：2017

6.C-terminally truncated constitutively active androgen receptor variants and their biologic and clinical significance in castration-resistant prostate cancer

作者：Anca Azoitei^a ; Axel S. Merseburger^b ; Beate Godau^b ; M. Raschid Hoda^b ; Evi Schmid^c ; Marcus V. Cronauer^b ; ^{marcus.cronauer@uksh.de}

关键词：aa ; amino-acids ; ADT ; androgen deprivation therapy ; AR ; androgen receptor ; ARΔLBD ; androgen receptor lacking a functional ligand binding domain ; AR-V ; AR splice variant ; BET ; bromodomain and extra-terminal ; CE ; cryptic exon ; CRPC ; castration-resistant prostate cancer ; CTC ; circulating tumor cell ; CTD ; carboxy-terminal domain ; DBD ; DNA-binding domain ; EMT ; epithelial-mesenchymal transition ; FFPE ; formalin-fixed paraffin-embedded ; HR ; hinge region ; I ; intron ; IF ; immunofluorescence ; IGF-1 ; insulin

刊名：The Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology

出版年：2017

7.No evidence of ischemia in stroke-like lesions of mitochondrial POLG encephalopathy

作者：Charalampos Tzoulis ; MD ; PhD^a ; ^b ; ¹ ; Eilen Henriksen ; MSc^b ; ¹ ; Hrvoje Miletic ; MD ; PhD^c ; ^d ; Laurence A. Bindoff ; MD ; PhD^a ; ^b ; ^{laurence.bindoff@nevro.uib.no}

关键词：COX ; cytochrome oxidase ; FFPE ; formalin-fixed paraffin embedded ; GFAP ; glial fibrillary acidic protein ; HE ; hematoxylin & eosin ; MRI ; magnetic resonance imaging ; MSCAE ; mitochondrial spinocerebellar ataxia and epilepsy ; MtDNA ; mitochondrial DNA ; POLG ; polymerase gamma ; SLE ; stroke-like episode ; BBB ; Blood brain barrier

刊名：Mitochondrion

出版年：2017

8.Identification of bacterial pathogens from formalin-fixed, paraffin-embedded tissues by using 16S sequencing: retrospective correlation of results to clinicians' responses

作者：Lori D. Racsa ; DO^a ; ¹ ; ^{Ldracsa@gmail.com} ; Marlene DeLeon-Carnes ; BS^b ; ^mld7@cdc.gov ; Matthew Hiskey ; MD^a ; ^{matthew.hiskey@emory.edu} ; Jeannette Guarner ; MD^a ; ^{jguarne@emory.edu}

关键词：16S ; Bacterial sequencing ; Paraffin samples ; Bacteria ; Infection

刊名：Human Pathology

出版年：2017

9.Detection of alpha human papillomaviruses in archival formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissue specimens

作者：Bo&scaron ; tjan J. Kocjan^a ; Lea Ho&scaron ; njak^a ; Mario Poljak^a ; ^b ; ^{mario.poljak@mf.uni-lj.si" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：Human papillomaviruses ; HPV ; Achival tissues specimens ; Formalin fixed ; Paraffin-embedded tissue ; FFPE

刊名：Journal of Clinical Virology

出版年：2016

10.Validation of a Gene Expression Test for Mesothelioma Prognosis in Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Tissues

作者：Assunta De Rienzo^&lowast ; ; Robert W. Cook^&dagger ; ; Jeff Wilkinson^&Dagger ; ; Corinne E. Gustafson^&lowast ; ; Waqas Amin^§ ; ; ^¶ ; ; Clare E. Johnson^&dagger ; ; Kristen M. Oelschlager^&dagger ; ; Derek J. Maetzold^&dagger ; ; John F. Stone^&Dagger ; ; Michael D. Feldman^§ ; ; ^‖ ; Michael J. Becich^§ ; ; ^‖ ; Beow Y. Yeap^&lowast ; &lowast ; ; William G. Richards^&lowast ; ; Raphael Bueno^&lowast ; ; ^{rbueno@partners.org}

刊名：The Journal of Molecular Diagnostics

出版年：2017

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