作者：Roadmap Epigenomics Consortium ; Anshul Kundaje ; Wouter Meuleman ; Jason Ernst ; Misha Bilenky ; Angela Yen ; Alireza Heravi-Moussavi ; Pouya Kheradpour ; Zhizhuo Zhang ; Jianrong Wang ; Michael J. Ziller ; Viren Amin ; John W. Whitaker ; Matthew D. Schultz ; Lucas D. Ward ; Abhishek Sarkar ; Gerald Quon ; Richard S. Sandstrom ; Matthew L. Eaton ; Yi-Chieh Wu ; Andreas R. Pfenning ; Xinchen Wang ; Melina Claussnitzer ; Yaping Liu ; Cristian Coarfa ; R. Alan Harris ; Noam Shoresh ; Charles B. Epstein ; Elizabeta Gjoneska ; Danny Leung ; Wei Xie ; R. David Hawkins ; Ryan Lister ; Chibo Hong ; Philippe Gascard ; Andrew J. Mungall ; Richard Moore ; Eric Chuah ; Angela Tam ; Theresa K. Canfield ; R. Scott Hansen ; Rajinder Kaul ; Peter J. Sabo ; Mukul S. Bansal ; Annaick Carles ; Jesse R. Dixon ; Kai-How Farh ; Soheil Feizi ; Rosa Karlic ; Ah-Ram Kim ; Ashwinikumar Kulkarni ; Daofeng Li ; Rebecca Lowdon ; GiNell Elliott ; Tim R. Mercer ; Shane J. Neph ; Vitor Onuchic ; Paz Polak ; Nisha Rajagopal ; Pradipta Ray ; Richard C. Sallari ; Kyle T. Siebenthall ; Nicholas A. Sinnott-Armstrong ; Michael Stevens ; Robert E. Thurman ; Jie Wu ; Bo Zhang ; Xin Zhou ; Arthur E. Beaudet ; Laurie A. Boyer ; Philip L. De Jager ; Peggy J. Farnham ; Susan J. Fisher ; David Haussler ; Steven J. M. Jones ; Wei Li ; Marco A. Marra ; Michael T. McManus ; Shamil Sunyaev ; James A. Thomson ; Thea D. Tlsty ; Li-Huei Tsai ; Wei Wang ; Robert A. Waterland ; Michael Q. Zhang ; Lisa H. Chadwick ; Bradley E. Bernstein ; Joseph F. Costello ; Joseph R. Ecker ; Martin Hirst ; Alexander Meissner ; Aleksandar Milosavljevic ; Bing Ren ; John A. Stamatoyannopoulos ; Ting Wang ; Manolis Kellis ; Roadmap Epigenomics Consortium

关键词：Epigenomics ; Data integration ; Regulatory networks ; Genome-wide association studies

刊名：Nature

出版年：2015

作者：Elizabeta Gjoneska ; Andreas R. Pfenning ; Hansruedi Mathys ; Gerald Quon ; Anshul Kundaje ; Li-Huei Tsai ; Manolis Kellis

关键词：Epigenetics in the nervous system

刊名：Nature

出版年：2015

作者：Carlos L. Araya ; Trupti Kawli ; Anshul Kundaje ; Lixia Jiang ; Beijing Wu ; Dionne Vafeados ; Robert Terrell ; Peter Weissdepp ; Louis Gevirtzman ; Daniel Mace ; Wei Niu ; Alan P. Boyle ; Dan Xie ; Lijia Ma ; John I. Murray ; Valerie Reinke ; Robert H. Waterston ; Michael Snyder

关键词：Gene regulation

刊名：Nature

出版年：2015

作者：Yong Cheng ; Zhihai Ma ; Bong-Hyun Kim ; Weisheng Wu ; Philip Cayting ; Alan P. Boyle ; Vasavi Sundaram ; Xiaoyun Xing ; Nergiz Dogan ; Jingjing Li ; Ghia Euskirchen ; Shin Lin ; Yiing Lin ; Axel Visel ; Trupti Kawli ; Xinqiong Yang ; Dorrelyn Patacsil ; Cheryl A. Keller ; Belinda Giardine ; The Mouse ENCODE Consortium ; Anshul Kundaje ; Ting Wang ; Len A. Pennacchio ; Zhiping Weng ; Ross C. Hardison ; Michael P. Snyder

关键词：Functional genomics ; Functional genomics

刊名：Nature

出版年：2014

作者：Joshua W. K. Ho ; Youngsook L. Jung ; Tao Liu ; Burak H. Alver ; Soohyun Lee ; Kohta Ikegami ; Kyung-Ah Sohn ; Aki Minoda ; Michael Y. Tolstorukov ; Alex Appert ; Stephen C. J. Parker ; Tingting Gu ; Anshul Kundaje ; Nicole C. Riddle ; Eric Bishop ; Thea A. Egelhofer ; Sheng' ; en Shawn Hu ; Artyom A. Alekseyenko ; Andreas Rechtsteiner ; Dalal Asker ; Jason A. Belsky ; Sarah K. Bowman ; Q. Brent Chen ; Ron A.-J. Chen ; Daniel S. Day ; Yan Dong ; Andrea C. Dose ; Xikun Duan ; Charles B. Epstein ; Sevinc Ercan ; Elise A. Feingold ; Francesco Ferrari ; Jacob M. Garrigues ; Nils Gehlenborg ; Peter J. Good ; Psalm Haseley ; Daniel He ; Moritz Herrmann ; Michael M. Hoffman ; Tess E. Jeffers ; Peter V. Kharchenko ; Paulina Kolasinska-Zwierz ; Chitra V. Kotwaliwale ; Nischay Kumar ; Sasha A. Langley ; Erica N. Larschan ; Isabel Latorre ; Maxwell W. Libbrecht ; Xueqiu Lin ; Richard Park ; Michael J. Pazin ; Hoang N. Pham ; Annette Plachetka ; Bo Qin ; Yuri B. Schwartz ; Noam Shoresh ; Przemyslaw Stempor ; Anne Vielle ; Chengyang Wang ; Christina M. Whittle ; Huiling Xue ; Robert E. Kingston ; Ju Han Kim ; Bradley E. Bernstein ; Abby F. Dernburg ; Vincenzo Pirrotta ; Mitzi I. Kuroda ; William S. Noble ; Thomas D. Tullius ; Manolis Kellis ; David M. MacAlpine ; Susan Strome ; Sarah C. R. Elgin ; Xiaole Shirley Liu ; Jason D. Lieb ; Julie Ahringer ; Gary H. Karpen ; Peter J. Park

关键词：Epigenomics ; Chromatin ; Computational biology and bioinformatics ; Chromatin analysis

刊名：Nature

出版年：2014

作者：Carlos L. Araya ; Trupti Kawli ; Anshul Kundaje ; Lixia Jiang ; Beijing Wu ; Dionne Vafeados ; Robert Terrell ; Peter Weissdepp ; Louis Gevirtzman ; Daniel Mace ; Wei Niu ; Alan P. Boyle ; Dan Xie ; Lijia Ma ; John I. Murray ; Valerie Reinke ; Robert H. Waterston ; Michael Snyder

关键词：Gene regulation

刊名：Nature

出版年：2014

作者：Alan P. Boyle ; Carlos L. Araya ; Cathleen Brdlik ; Philip Cayting ; Chao Cheng ; Yong Cheng ; Kathryn Gardner ; LaDeana W. Hillier ; Judith Janette ; Lixia Jiang ; Dionna Kasper ; Trupti Kawli ; Pouya Kheradpour ; Anshul Kundaje ; Jingyi Jessica Li ; Lijia Ma ; Wei Niu ; E. Jay Rehm ; Joel Rozowsky ; Matthew Slattery ; Rebecca Spokony ; Robert Terrell ; Dionne Vafeados ; Daifeng Wang ; Peter Weisdepp ; Yi-Chieh Wu ; Dan Xie ; Koon-Kiu Yan ; Elise A. Feingold ; Peter J. Good ; Michael J. Pazin ; Haiyan Huang ; Peter J. Bickel ; Steven E. Brenner ; Valerie Reinke ; Robert H. Waterston ; Mark Gerstein ; Kevin P. White ; Manolis Kellis ; Michael Snyder

关键词：Comparative genomics ; Evolutionary genetics ; Gene regulatory networks ; Evolutionary biology

刊名：Nature

出版年：2014

作者：Feng Yue ; Yong Cheng ; Alessandra Breschi ; Jeff Vierstra ; Weisheng Wu ; Tyrone Ryba ; Richard Sandstrom ; Zhihai Ma ; Carrie Davis ; Benjamin D. Pope ; Yin Shen ; Dmitri D. Pervouchine ; Sarah Djebali ; Robert E. Thurman ; Rajinder Kaul ; Eric Rynes ; Anthony Kirilusha ; Georgi K. Marinov ; Brian A. Williams ; Diane Trout ; Henry Amrhein ; Katherine Fisher-Aylor ; Igor Antoshechkin ; Gilberto DeSalvo ; Lei-Hoon See ; Meagan Fastuca ; Jorg Drenkow ; Chris Zaleski ; Alex Dobin ; Pablo Prieto ; Julien Lagarde ; Giovanni Bussotti ; Andrea Tanzer ; Olgert Denas ; Kanwei Li ; M. A. Bender ; Miaohua Zhang ; Rachel Byron ; Mark T. Groudine ; David McCleary ; Long Pham ; Zhen Ye ; Samantha Kuan ; Lee Edsall ; Yi-Chieh Wu ; Matthew D. Rasmussen ; Mukul S. Bansal ; Manolis Kellis ; Cheryl A. Keller ; Christapher S. Morrissey ; Tejaswini Mishra ; Deepti Jain ; Nergiz Dogan ; Robert S. Harris ; Philip Cayting ; Trupti Kawli ; Alan P. Boyle ; Ghia Euskirchen ; Anshul Kundaje ; Shin Lin ; Yiing Lin ; Camden Jansen ; Venkat S. Malladi ; Melissa S. Cline ; Drew T. Erickson ; Vanessa M. Kirkup ; Katrina Learned ; Cricket A. Sloan ; Kate R. Rosenbloom ; Beatriz Lacerda de Sousa ; Kathryn Beal ; Miguel Pignatelli ; Paul Flicek ; Jin Lian ; Tamer Kahveci ; Dongwon Lee ; W. James Kent ; Miguel Ramalho Santos ; Javier Herrero ; Cedric Notredame ; Audra Johnson ; Shinny Vong ; Kristen Lee ; Daniel Bates ; Fidencio Neri ; Morgan Diegel ; Theresa Canfield ; Peter J. Sabo ; Matthew S. Wilken ; Thomas A. Reh ; Erika Giste ; Anthony Shafer ; Tanya Kutyavin ; Eric Haugen ; Douglas Dunn ; Alex P. Reynolds ; Shane Neph ; Richard Humbert ; R. Scott Hansen ; Marella De Bruijn ; Licia Selleri ; Alexander Rudensky ; Steven Josefowicz ; Robert Samstein ; Evan E. Eichler ; Stuart H. Orkin ; Dana Levasseur ; Thalia Papayannopoulou ; Kai-Hsin Chang ; Arthur Skoultchi ; Srikanta Gosh ; Christine Disteche ; Piper Treuting ; Yanli Wang ; Mitchell J. Weiss ; Gerd A. Blobel ; Xiaoyi Cao ; Sheng Zhong ; Ting Wang ; Peter J. Good ; Rebecca F. Lowdon ; Leslie B. Adams ; Xiao-Qiao Zhou ; Michael J. Pazin ; Elise A. Feingold ; Barbara Wold ; James Taylor ; Ali Mortazavi ; Sherman M. Weissman ; John A. Stamatoyannopoulos ; Michael P. Snyder ; Roderic Guigo ; Thomas R. Gingeras ; David M. Gilbert ; Ross C. Hardison ; Michael A. Beer ; Bing Ren ; The Mouse ENCODE Consortium

关键词：Epigenomics

刊名：Nature

出版年：2014

作者：Mark B. Gerstein ; Anshul Kundaje ; Manoj Hariharan ; Stephen G. Landt ; Koon-Kiu Yan ; Chao Cheng ; Xinmeng Jasmine Mu ; Ekta Khurana ; Joel Rozowsky ; Roger Alexander ; Renqiang Min ; Pedro Alves ; Alexej Abyzov ; Nick Addleman ; Nitin Bhardwaj ; Alan P. Boyle ; Philip Cayting ; Alexandra Charos ; David Z. Chen ; Yong Cheng ; Declan Clarke ; Catharine Eastman ; Ghia Euskirchen ; Seth Frietze ; Yao Fu ; Jason Gertz ; Fabian Grubert ; Arif Harmanci ; Preti Jain ; Maya Kasowski ; Phil Lacroute ; Jing Leng ; Jin Lian ; Hannah Monahan ; Henriette O’Geen ; Zhengqing Ouyang ; E. Christopher Partridge ; Dorrelyn Patacsil ; Florencia Pauli ; Debasish Raha ; Lucia Ramirez ; Timothy E. Reddy ; Brian Reed ; Minyi Shi ; Teri Slifer ; Jing Wang ; Linfeng Wu ; Xinqiong Yang ; Kevin Y. Yip ; Gili Zilberman-Schapira ; Serafim Batzoglou ; Arend Sidow ; Peggy J. Farnham ; Richard M. Myers ; Sherman M. Weissman ; Michael Snyder

关键词：Genomics ; Genetics

刊名：Nature

出版年：2012