红河州HCV基因亚型的多样性及6a亚型的种系进化研究

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• 论文作者：杨兰辉 ; 霍松 ; 史微 ; 陈梅 ; 马兴丽 ; 李婷 ; 李佳
• 年：2016
• 作者机构：红河州第一人民医院检验科;红河州第一人民医院感染科;
• 论文关键词：丙型肝炎 ; 基因型 ; 基因亚型 ; 种系进化分析
• 会议召开时间：2016-09-09
• 会议录名称：第七届中国临床微生物学大会暨微生物学与免疫学论坛论文汇编
• 语种：中文
• 分类号：R512.63;R446.6
• 学会代码：WSWZ
• 会议名称：第七届中国临床微生物学大会暨微生物学与免疫学论坛
• 会议地点：中国浙江宁波
• 主办单位：中国微生物学会临床微生物学专业委员会、医学参考报社、宁波大学、宁波大学医学院附属医院
• 学会名称：中国微生物学会临床微生物学专业委员会
• 页数：1
• 文件大小：42k
• 原文格式：O
• 会议级别：全国

摘要

目的红河州地区HIV和HCV病毒的感染流行率均较高。本研究的目的是探讨红河州地区HCV病毒基因型和亚型的流行分布及种系进化多样性。方法 100名红河州内HCV-RNA阳性丙型肝炎患者参与了此项研究,HCV单纯感染和HCV/HIV合并感染各50例。扩增C/E1和NS5B两个基因位点,通过测序分析和种系进化分析以明确研究对象所感染的HCV病毒的基因型和亚型。结果综合两个外显子序列分析和种系进化分析,结果显示红河州地区流行的HCV以3b亚型最多见(38.0%),其次是6n(20.0%)、3a(17.0%)、6a(12.0%)、1b(9.0%)、双重感染(2.0%)、6v(1%)和一个疑似基因6型内的新亚型(1%)。HCV 6a亚型在红河州静脉吸毒人群(IDUs)中普遍流行(20.0%)。6a亚型在本地区丙型肝炎血液接触感染者和IDUs中的流行率存在统计学差异(p=0.020)。此外,6a是越南一个高流行的HCV基因亚型,课题组做本地区HCV 6a亚型遗传进化分析时发现红河州地区流行的6a亚型毒株序列与越南的HCV6a亚型的毒株参考序列丛集,表明越南和红河州地区分离的HCV 6a亚型具有进化关系。结论 HCV 6a亚型是越南和红河州内IDUs中高流行的病毒亚型,由于与越南接壤,红河州可能是HCV6a亚型通过静脉吸毒途径由越南传入中国流行的一个传入点。另一方面,我们推测本研究中发现的这例未分型的HCV毒株,可能是HCV基因型6型中的一例新亚型毒株。

引文