高通量测序技术在饮用水微生物多样性研究中的应用

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• 英文论文题名：Application of high-throughput sequencing techniques in studies of drinking watermicrobial diversity
• 论文作者：古其会 ; 吴清平 ; 张菊梅 ; 吴慧清 ; 孙铭
• 英文论文作者：Gu Qihui ; Wu Qingping ; Zhang Jumei ; Wu Huiqing ; Sun Ming ; Guangdong Institute of Microbiology ; State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China ; Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application and Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology ; School of Bioscience and Bioengineering ; South China University of Technology ; Guangzhou Institute of Chemistry ; University of Chinese Academy of Sciences
• 年：2016
• 作者机构：广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室;华南理工大学生物科学与工程学院;中科院广州化学研究所;中国科学院大学;
• 论文关键词：饮用水 ; 高通量测序技术 ; 微生物多样性
• 英文论文关键词：drinking water ; high throughput sequencing technology ; microbial diversity
• 会议召开时间：2016-11-09
• 会议录名称：中国食品科学技术学会第十三届年会论文摘要集
• 英文会议录名称：Abstracts of the 13th Annual Meeting of CIFST
• 语种：中文
• 分类号：R123.1
• 学会代码：ZGSP
• 会议名称：中国食品科学技术学会第十三届年会
• 会议地点：中国北京
• 主办单位：中国食品科学技术学会
• 学会名称：中国食品科学技术学会
• 页数：2
• 文件大小：100k
• 原文格式：O
• 会议级别：全国

摘要

微生物在饮用水处理过程中的作用是非常重要的,尤其生物滤池中的微生物对饮用水有机物去除起到了关键作用。而对该环境中的微生物群落结构及多样性缺乏系统全面的研究,主要是采用传统的分离培养、DNA指纹图谱技术、磷脂脂肪酸分析法及微阵列基因芯片等技术,但存在通量低和信息量小等缺点。随着第二代高通量测序技术的发展,克服了以上缺点,对于我们全面、准确和快速地了解生物滤池中的微生物群落结构及功能多样性提供了一个很好的手段。为此,本文在重点介绍第二代高通量测序技术,包括测序仪原理、类型及优越性,并在此基础上综述了该技术在分析饮用水环境微生物群落多样性中的应用。同时得出了高通量测序技术在饮用水环境微生物群落的多样性研究中具有很大的应用价值,为生物处理技术在饮用水生产中的更好应用奠定了坚实的理论基础。
Indigenous bacterial communities are essential for drinking water treatment,especially in biofilters for organic mattersremoval,yet microbial community structure remains poorly characterized.Therearemanymethodshavebeenusedforanalyzing microbial diversity,including traditional isolation and culture methods,DNA fingerprintion,phospholipid fatty acid analysis and gene-chip.However,these methodssufferfromseveraldrawbackssuchas low through-put and less information.High throughput sequencingprovides agood tool to systemataciallyanalyzemicrobial community structure in biofilters.Therefore,the aim of this study is to introduce the principle and advantages of high throughput sequencing and sequencertype,and summarize the application of high throughput sequencingin analyzing microbial community diversity in drinking water environment.Meanwhile,weconclude that high throughput sequencingis of great value in application in studying microbial community diversity of drinking water,which lay a solid theoretical basis to make biological treatment technologybetter apply in drinking water treatment process.

引文