A refined probe design strategy for RNA capture and profiling

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• 英文论文题名：A refined probe design strategy for RNA capture and profiling
• 论文作者：Yuning Zhang ; Shaojun Zhang ; Xingyang Qian ; Kui Xu ; 张强锋
• 英文论文作者：Yuning Zhang ; Shaojun Zhang ; Xingyang Qian ; Kui Xu ; Qiangfeng Cliff Zhang ; MOE Key Laboratory of Bioinformatics ; Center for Synthetic and Systems Biology ; Center for Tsinghua-Peking Joint Center for Life Sciences ; School of Life Sciences ; Tsinghua University
• 年：2016
• 作者机构：清华大学生命科学学院;
• 会议召开时间：2016-09-25
• 会议录名称：第九届全国核糖核酸学术讨论会论文集
• 语种：英文
• 分类号：Q75
• 学会代码：IGSS
• 会议名称：第九届全国核糖核酸学术讨论会
• 会议地点：中国上海
• 主办单位：中国生物化学与分子生物学会核糖核酸专业委员会
• 学会名称：中国生物化学与分子生物学会
• 页数：1
• 文件大小：175k
• 原文格式：D
• 会议级别：全国

摘要

<正>Background:Newly developed RNA capture and profiling assays like Ch IRP sonicate RNAs into pieces of a few hundred nucleotides and then use biotin-labeled oligonucleotide probes to retrieve targetRNAs from cell lysate.Existing methods usually only design probes in non-homologous regions of targetRNAs,often resulting in big gaps(>500nt)without any probe coverage.Since RNA together with

引文