大珠母贝微卫星DNA标记的分离与筛选

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• 出版年：2010
• 作者：柳明；喻达辉；黄桂菊
• 单位1：农业部海水养殖生态与质量控制重点开放实验室，中国水产科学研究院 南海水产研究所
• 单位2：上海海洋大学 水产与生命学院
• 出生年：1984
• 学历：硕士研究生
• 语种：中文
• 作者关键词：大珠母贝（Pinctada maxima）；磁珠富集法；微卫星；遗传多样性
• 起始页：1
• 总页数：6
• 经费资助：国家863计划项目（2006AA10A415）；国家科技支撑计划项目（2007BAD29B01-5）；广东省科技推广项目（A200701C02，A200-899C04，A200900A07）；中央级公益性科研院所基本科研业务费资助项目（2007TS07，2009YD02）
• 刊名：海洋科学
• 是否内版：否
• 刊频：月刊
• 创刊时间：1977
• 主管单位：中国科学院
• 主办单位：中国科学院海洋研究所
• 主编：侯一筠
• 地址：青岛南海路7号
• 邮编：266071
• 电子信箱：pxzhang@ms.qdio.ac.cn
• 网址：Http://159.226.158.205
• 卷：34
• 期：8
• 期刊索取号：P226.06 449-22
• 数据库收录：中国自然科学核心期刊
• 核心期刊：中国自然科学核心期刊

摘要

采用生物素标记的（CA）₁₅探针和磁珠富集法构建了大珠母贝（Pinctada maxima）微卫星DNA文库，随机挑选1200个菌落，经PCR筛选得到298个候选克隆，成功测序246个，分析获得251个微卫星序列，其中完美型、非完美型和混合型分别占63%、32%和5%。除探针中使用的CA重复外，还得到AT、GT、TC、AG、GC、TAA、CAA、AGG、GATA、GACA、GTGC、CGTC、GACG、CTGT等重复序列。设计引物90对，挑选其中30对合成并筛选出21对能在大珠母贝基因组有效扩增的引物。种群PCR扩增后利用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳法进行检测，获得了10个多态位点，共检测出59个等位基因，片段长度范围为133～444bp。各位点等位基因数2～8个，平均等位基因数5.9个；有效等位基因数为1.3423～6.0000，平均为4.1240；多态性信息含量（C_PI）为0.2225～0.8118，平均0.7179；期望杂合度（H_e）为0.2593～0.8475，平均0.7179；观测杂合度（H_o）为0.3000～0.8000，平均0.5333。这些微卫星多态性标记的获得，为进一步开展大珠母贝遗传育种、保护生物学和种群遗传多样性等研究奠定了一定基础。