日本蟳线粒体16SrRNA和COI基因序列比较分析

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• 出版年：2010
• 作者：高俊娜；刘萍；李健；潘鲁青；高保全；陈萍
• 单位1：中国水产科学院黄海水产研究所
• 单位2：中国海洋大学
• 出生年：1984
• 学历：硕士生
• 语种：中文
• 作者关键词：日本蟳；16S rRNA基因；COI基因；遗传多样性
• 起始页：57
• 总页数：7
• 经费资助：国家高技术研究发展计划项目（2006AA10A406）；国家自然科学基金项目（30871933）；青岛市科技计划项目（07-2-3-5-jch）资助
• 刊名：中国海洋大学学报（自然科学版）
• 是否内版：否
• 刊频：月刊
• 创刊时间：1959
• 主管单位：中华人民共和国教育部
• 主办单位：中国海洋大学
• 主编：管华诗
• 地址：青岛市鱼山路5号
• 邮编：266003
• 卷：40
• 期：12
• 期刊索取号：P226.066 110-1
• 数据库收录：中国科学技术信息研究所核心期刊；中国科学院文献情报中心核心期刊；北京大学图书馆核心期刊；CA 美国 《化学文摘》；AJ 俄罗斯 《文摘杂志》；ZR 英国 《动物学记录》；MR 美国 《数学评论》；ZM 德国 《数学文摘》；CSA 美国 “剑桥科学文摘社网址”之 水科学与渔业文摘C 海洋文摘，污染文摘C 环境科学与污染管理C 接卸工程文摘S 机械与运输工程文摘S 土木工程文摘S
• 核心期刊：中国科学技术信息研究所核心期刊；中国科学院文献情报中心核心期刊；北京大学图书馆核心期刊

摘要

对采自莱州湾和胶州湾的日本蟳野生群体的线粒体16SrRNA和COI基因片段进行了PCR扩增和测序，分别得到长度为519和658bp的碱基序列。研究结果显示这2个基因片段在种内的变异都较低，对2个基因同源序列分析表明，在线粒体16SrRNA基因片段中共检测到7个变异位点（包括6个单一变异位点，1个简约信息位点）和7种单倍型；在COI基因中共检测到8个变异位点（包括6个单一变异位点，2个简约信息位点）和7种单倍型。通过统计变异位点、平均核苷酸差异数和核苷酸多样性指数，分析比较了两群体间的序列差异和遗传多样性水平，结果显示2个日本蟳野生群体的遗传多样性比较丰富。用MEGA4.0软件构建了NJ和UPMGA系统树，基于16SrRNA基因片段的系统树显示梭子蟹科的4个属聚为两大支：日本蟳不同的单倍型先聚在一起，然后与青蟹属的3种蟹聚为一支；梭子蟹属的三疣梭子蟹、远海梭子蟹及塞氏梭子蟹聚在一起；再与美青蟹属的美洲蓝蟹、巴西蓝蟹等聚为一支。基于COI基因显示日本蟳不同的单倍型先聚在一起，再与其他3种蟳聚为一支；梭子蟹属的远海梭子蟹和三疣梭子蟹相聚，然后与美青蟹属的2种蟹相聚为一支。该结果与传统分类一致。这些数据为我国日本蟳的种质资源保护和利用提供了基础的分子生物学依据。