海湾扇贝微卫星标记开发及其分离方式分析

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• 出版年：2009
• 作者：李宏俊；刘晓；杜雪地；宋蕊；张国范；胡景杰；包振民
• 单位1：中国科学院海洋研究所
• 单位2：中国科学院研究生院
• 出生年：1982
• 学历：博士研究生
• 语种：中文
• 作者关键词：海湾扇贝（Argopecten irradians）；微卫星；富集文库；无效等位基因；分离方式
• 起始页：4
• 总页数：5
• 经费资助：国家863计划重大项目(2006AA10A407)；国家自然科学基金项目(30371117)
• 刊名：海洋科学
• 是否内版：否
• 刊频：月刊
• 创刊时间：1977
• 主管单位：中国科学院
• 主办单位：中国科学院海洋研究所
• 主编：侯一筠
• 地址：青岛南海路7号
• 邮编：266071
• 电子信箱：pxzhang@ms.qdio.ac.cn
• 网址：Http://159.226.158.205
• 卷：33
• 期：12
• 期刊索取号：P226.06 449-22
• 核心期刊：中国自然科学核心期刊

摘要

利用尼龙膜吸附杂交法构建了海湾扇贝的(AC)₁₅、(AG)₁₅微卫星富集文库，随机挑取3000个克隆，经菌落原位杂交二次筛选共获得阳性克隆1268个(42.3%)。经序列测定和生物信息学分析后得到521个独立的阳性克隆，其中微卫星506个，小卫星15个。微卫星中，完美型248个，占总数的49.0%；非完美型216个，占42.7%；复合型42个，占8.3%；其中AG/TC重复占70.4%（356个），AC/TG重复29.6%（150个）。选择其中的55条序列设计引物，筛选出其中的20对引物检测它们在海湾扇贝CC10家系的双亲和94个子代个体中的分离情况，结果表明：(1)其中6个位点在母本和子代中发生分离，10个位点在父本和子代中发生分离，4个为双亲共享位点；(2)2个位点存在无效等位基因；(3)16个位点符合孟德尔遗传定律，4个位点的子代个体基因型频率偏离孟德尔遗传定律。上述结果表明，这些微卫星引物可以用于构建海湾扇贝的遗传连锁图谱，并且所构建的富集文库适用于微卫星标记的大规模开发。