自发性高血压大鼠胸主动脉中环状RNA的筛选及其潜在功能研究

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	作者：谭娟娟 ; 谢亦璘 ; 沈莉 ; 李蕾 ; 秦迎春 ; 严志强 关键词：高张应变 ; 力学加载 ; RNA测序 ; 环状RNA ; 血管重建 中文刊名：YISX 英文刊名：Journal of Medical Biomechanics 机构：上海交通大学与奉贤医院精准医疗联合中心;上海交通大学生命科学技术学院;南方医科大学附属奉贤医院心内科;上海中医药大学;南方医科大学附属奉贤医院中心实验室; 出版日期：2019-07-15 出版单位：医用生物力学 年：2019 期：v.34 基金：国家自然科学基金项目(31570949) 语种：中文; 页：YISX2019S1142 页数：1 CN：S1 ISSN：31-1624/R 分类号：97

摘要

背景高血压是导致多种心脑血管疾病的主要危险因素,严重威胁着人类的健康。随着第二代测序技术的不断成熟,越来越多的环状RNA(circular RNA,circRNA)被识别和鉴定出来,扩充了非编码RNA家族的种类和功能。近来,研究发现circRNA在心血管疾病中具有重要作用,但其在高血压中的作用及机制尚未完全明确。目的探究circRNA在自发性高血压大鼠血管重建中的作用及其潜在功能机制。方法采用Illumina公司二代测序平台Hiseq 1500,针对自发性高血压大鼠和正常血压大鼠的胸主动脉组织RNA进行全转录组二代测序,通过生物信息学算法CIRCexplorer来识别鉴定circRN As,构建circRNA表达谱。采用R平台下的DESeq2软件进行差异表达分析,筛选出显著差异表达的circRNAs,并结合生物信息学方法综合分析。利用qRT-PCR方法将随机选择的6个差异表达的circRNAs在胸主动脉及加载15%高张应变的血管平滑肌细胞中进行验证。结果通过二代测序方法,共识别出687个显著差异表达的circRNAs,其中165个circRNAs表达显著上调,522个circRNAs表达显著下调;qRT-PCR结果与测序结果一致。对差异表达的circRN As进行功能预测提示其与相应的miRNAs具有多个结合位点;GO和KECGG分析提示这些差异表达circRN As的宿主基因具有重要的生物学功能。结论 circRNAs在自发性高血压大鼠和正常血压大鼠的胸主动脉中具有显著表达差异;生物信息学显示,差异表达的circRNAs可能通过竞争性吸附miRNAs发挥相应的生物学功能,或与其宿主基因一起参与高血压血管重建过程,可能具有潜在的诊断应用价值。
        

引文