姜曲海猪瘦肉型品种培育过程中辅助选择标记的探索研究
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摘要
本研究以姜益海猪瘦肉型新品种两基础亲本猪为试验材料，对45个10碱基寡聚核苷酸随机引物进行RAPD扩增，用两亲本群体池DNA对引物进行筛选，各群体个体基因组DNA进行全面试验，用于姜曲海猪亲本的群体遗传变异程度分析，同时利用广义线性模型(GLM)分析部分多态性RAPD标记与两基础亲本猪日增重、背膘厚及肉品质的关系。另外，本论文还采用放射免疫分析法(RIA)对同批试验材料的血清进行激素(生长激素和甲状腺素)浓度测定，研究它们与两基础亲本猪日增重、背膘厚的相关性。结果表明：
1．姜曲海猪瘦肉型新品种基础亲本猪80日龄生长激素水平与背膘厚存在极显著的负相关(P＜0.01)，与日增重有显著的正相关(P＜0.05)，甲状腺素与生产性能之间未见显著相关。
2．本试验中11个随机引物计算得到的群体平均条带共享率、平均遗传多样性指数，反映的姜曲海猪瘦肉型新品种两基础亲本猪杜枫姜猪和杜杜枫姜猪的遗传变异程度和实际选育情况一致，杜枫姜猪与杜杜枫姜猪间平均条带共享率和平均遗传多样性指数均存在显著差异(P＜0.05)。
3．S152引物的两条多态性条带(分子量分别为1470bp和1535bp)组合，S19引物的一条多态性条带的有、无(分子量为892bp)均对姜曲海猪瘦肉型新品种两基础亲本猪的生产性能有显著影响，其中S152引物的S152A组合(两条带均存在)和S152B组合(快带有、慢带无)对平均日增重、熟肉率、肉色均有显著的正向效应(P＜0.05)，对背膘厚、失水率均存在显著的负向效应(P＜0.05)。可用于标记辅助选择。
In order to reveal the population genetic variation and the correlations between RAPD markers and daily weight gain, backfat thickness, meat quality in Jiangquhai porcine lean strain. Random amplified polymorphic DNA was used with 45 arbitrary 10-mer oligonucleotide primers to assess population genetic variation, GLM (general linear model)was used to find out the correlations between polymorphic RAPD markers and production performance. In addition, RIA(radio immuno analysis) was used to mensurate hormone consistency, for example, Growth Hormone and thyroxine. So that we could study the correlations between them and production performance in Jiangquhai porcine. The main results were as follows:
The consistency of Growth Hormone have a significant positive correlation with daily weight gain(P<0.05), and have a extremely significant negative correlation with backfat thickness of Jiangquhai porcine lean strain(P<0.01). Thyroxine have no significant correlation with production performance.
The average of band sharing frequency(BSF) and the coefficient of genetic diversity(H) reflect the genetic variation level and the real selection condition of Jiangquhai porcine. The average of BSF of Dufengjiang is significant less than that of Dudufengjiang(P<0.05), the average of H is on the contrary.
There are significant influence on some production performance among the combination of two polymorphic bands from arbitrary primer S152(the bands M.W. is 1470 and 1535 respectivly) and between one polymorphic band of arbitrary primer S19 have and have not. The S152 arbitrary primer bands combination S152A(the two polymorphic bands were all appear in RAPD fingerprinting), S152B(only the band with the M.W. 1470 is appear in RAPD fingerprinting) have significant positive model effect on the average daily weight gain, cooked meat percentage and meat color, and have significant negative model effect on backfat thickness and water loss percentage in Jiangquhai porcine. It indicated that the band combinations may be applied to selection in marker-assisted selection.
1．姜曲海猪瘦肉型新品种基础亲本猪80日龄生长激素水平与背膘厚存在极显著的负相关(P＜0.01)，与日增重有显著的正相关(P＜0.05)，甲状腺素与生产性能之间未见显著相关。
2．本试验中11个随机引物计算得到的群体平均条带共享率、平均遗传多样性指数，反映的姜曲海猪瘦肉型新品种两基础亲本猪杜枫姜猪和杜杜枫姜猪的遗传变异程度和实际选育情况一致，杜枫姜猪与杜杜枫姜猪间平均条带共享率和平均遗传多样性指数均存在显著差异(P＜0.05)。
3．S152引物的两条多态性条带(分子量分别为1470bp和1535bp)组合，S19引物的一条多态性条带的有、无(分子量为892bp)均对姜曲海猪瘦肉型新品种两基础亲本猪的生产性能有显著影响，其中S152引物的S152A组合(两条带均存在)和S152B组合(快带有、慢带无)对平均日增重、熟肉率、肉色均有显著的正向效应(P＜0.05)，对背膘厚、失水率均存在显著的负向效应(P＜0.05)。可用于标记辅助选择。
In order to reveal the population genetic variation and the correlations between RAPD markers and daily weight gain, backfat thickness, meat quality in Jiangquhai porcine lean strain. Random amplified polymorphic DNA was used with 45 arbitrary 10-mer oligonucleotide primers to assess population genetic variation, GLM (general linear model)was used to find out the correlations between polymorphic RAPD markers and production performance. In addition, RIA(radio immuno analysis) was used to mensurate hormone consistency, for example, Growth Hormone and thyroxine. So that we could study the correlations between them and production performance in Jiangquhai porcine. The main results were as follows:
The consistency of Growth Hormone have a significant positive correlation with daily weight gain(P<0.05), and have a extremely significant negative correlation with backfat thickness of Jiangquhai porcine lean strain(P<0.01). Thyroxine have no significant correlation with production performance.
The average of band sharing frequency(BSF) and the coefficient of genetic diversity(H) reflect the genetic variation level and the real selection condition of Jiangquhai porcine. The average of BSF of Dufengjiang is significant less than that of Dudufengjiang(P<0.05), the average of H is on the contrary.
There are significant influence on some production performance among the combination of two polymorphic bands from arbitrary primer S152(the bands M.W. is 1470 and 1535 respectivly) and between one polymorphic band of arbitrary primer S19 have and have not. The S152 arbitrary primer bands combination S152A(the two polymorphic bands were all appear in RAPD fingerprinting), S152B(only the band with the M.W. 1470 is appear in RAPD fingerprinting) have significant positive model effect on the average daily weight gain, cooked meat percentage and meat color, and have significant negative model effect on backfat thickness and water loss percentage in Jiangquhai porcine. It indicated that the band combinations may be applied to selection in marker-assisted selection.
引文
1. Welsh J, Mecelland M. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers. NUCL. Acids Res. 1990,18:7213-7218.
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