三种盅口科线虫线粒体全基因组比较
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- 论文作者：高远 ; 段红 ; 宿欣 ; 付雪 ; 张艳 ; 王春仁
- 年：2016
- 作者机构：黑龙江八一农垦大学动物科技学院;
- 论文关键词：盅口科 ; 碗形盅口线虫 ; 鼻状杯环线虫 ; 异齿盆口线虫 ; 线粒体基因组全序列 ; 进化分析
- 会议召开时间：2016-08-08
- 会议录名称：中国动物学会寄生虫学专业委员会第十届全国寄生虫学青年工作者学术研讨会论文摘要集
- 英文会议录名称：The Abstracts of the Tenth Symposium for Yong Scientists of China Society of Parasitology
- 语种：中文
- 分类号：S852.731
- 学会代码：JISC
- 会议名称：中国动物学会寄生虫学专业委员会第十届全国寄生虫学青年工作者学术研讨会
- 会议地点：中国四川成都
- 主办单位：中国动物学会寄生虫学专业青年委员会
- 学会名称：中国动物学会寄生虫学专业委员会
- 页数：1
- 文件大小：603k
- 原文格式：D
- 会议级别：全国
摘要
目的扩增获得盅口科的碗形盅口线虫、鼻状杯环线虫和异齿盆口线虫的线粒体全基因组序列并进行比较分析,同时分析三种线虫与其它线虫间的亲缘关系。方法采取常规PCR方法对三种线虫线粒体全基因组进行扩增、测序,以12个蛋白编码基因为基因标记构建系统发生树,分析他们间的亲缘关系。结果三种盅口科线虫的线粒体全基因组全长分别为13,838 bp、13,846 bp和13,814bp,线粒体基因组全序列的同源性变化范围为84.2%~87.8%,蛋白质编码基因的核苷酸序列同源性变化范围为80.7%~93.2%。其中同源性最高的基因为nad4L,同源性最低的基因为nad6。基于线粒体12个蛋白质编码基因核苷酸序列,利用最大简约法(MP)与其他12种寄生线虫共同构建系统发生树,在进化树中寄生于呼吸系统的线虫和寄生于消化系统的线虫各形成一个大的分支。在寄生于消化系统线虫分支中,四种盅口科的线虫聚集在一起形成一个分支。结论首次获得了三种线虫线粒体基因组全序列。进化分析表明杯环属二种线虫与碗形盅口线虫的亲缘关系较异齿盆口线虫近。
引文