Sneb821诱导番茄抗根结线虫转录组测序及分析

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• 论文作者：赵丹 ; 周园园 ; 尤杨 ; 朱晓峰 ; 王媛媛 ; 段玉玺 ; 陈立杰
• 年：2016
• 作者机构：沈阳农业大学北方线虫研究所;
• 论文关键词：番茄 ; 根结线虫 ; 诱导抗性 ; 转录组测序
• 会议召开时间：2016-08-05
• 会议录名称：中国植物病理学会2016年学术年会论文集
• 英文会议录名称：Proceedings of the Annual Meeting of Chinese Society for Plant Pathology(2016)
• 语种：中文
• 分类号：S436.412
• 学会代码：ZGVS
• 会议名称：中国植物病理学会2016年学术年会
• 会议地点：中国江苏南京
• 主办单位：中国植物病理学会
• 学会名称：中国植物病理学会
• 页数：1
• 文件大小：52k
• 原文格式：O
• 会议级别：全国

摘要

根结线虫(Meloidogyne spp.)是一种高度专化型的杂食性植物病原线虫,其寄主十分广泛,由于轮作、抗线品种和化学防治等方法依然存在局限性,国际上逐渐采用生物防治的方法来控制病害的严重发生。Sneb821是由沈阳农业大学北方线虫研究所分离获得并保存,Sneb821可诱导番茄抗南方根结线虫。为系统研究其诱抗机理,采用新一代高通量测序技术Illumina HiSeq~(TM)2500对不同处理的番茄样品进行转录组测序和生物信息学分析。共得到34.71Gb Clean Data,各样品Q30碱基百分比均不小于93.57%。接种南方根结线虫6d后,Sneb 821包衣处理与未处理相比,共有1997个差异基因,其中上调847个,下调1 150个,以KEGG数据库作为参考,依据代谢途径可将unigenes定位到406个代谢途径分支;Sneb 821包衣后接种线虫与未处理接种线虫相比,共有1 932个差异基因,其中上调962个,下调970个,依据代谢途径可将unigenes定位到332个代谢途径分支。同时,对差异表达基因进行基因本体注释,蛋白质直系同源簇注释,结果显示,GO注释和COG注释分别将差异表达基因分为了53个和26个功能类别,共涉及物质及能量代谢、信号传导、转录调控及防卫反应等诸多生理生化过程。其中,参与到激素信号转导途径,过氧化物酶代谢,铁离子运输等过程中的差异基因最多。过滤掉编码的肽链过短(少于50个氨基酸残基)或只包含单个外显子的序列,共发掘553个新基因。使用BLAST软件将发掘的新基因与NR,Swiss-Pro,GO,COG,KOG,Pfam,KEGG数据库进行序列比对,获得377个新基因的注释信息。这些数据为进一步明确诱抗机制及抗病基因功能验证等研究提供了依据。

引文