普通烟草NtCOMT基因的生物信息学分析

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英文篇名：Bioinformatics Analysis of the NtCOMT Gene in Tobacco 作者：彭宣翔 ; 陈夏晔 英文作者：PENG Xuanxiang;CHEN Xiaye;Chenzhou Branch Company of Hunan Tobacco Company; 关键词：烟草 ; 木质素 ; 咖啡酸-O-甲基转移酶 ; 基因工程 英文关键词：tobacco;;lignin;;COMT;;genetic engineering 中文刊名：GATE 英文刊名：Guizhou Agricultural Sciences 机构：湖南省烟草公司郴州市公司; 出版日期：2019-06-15 出版单位：贵州农业科学 年：2019 期：v.47;No.346 语种：中文; 页：GATE201906003 页数：5 CN：06 ISSN：52-1054/S 分类号：14-18

摘要

为研究烟草木质素生物合成的分子调控机制,进而为烟草工业提供低害烟叶,利用生物信息学相关分析方法在普通烟草K326基因组中鉴定普通烟草的20个NtCOMT基因,并对其序列、进化树、蛋白性质、表达谱等进行分析。结果表明:多数烟草NtCOMT蛋白约含360个氨基酸残基,分子量在37～41kDa,烟草NtCOMT蛋白约有1/2定位于细胞质,1/2定位于胞外,烟草NtCOMT家族基因结构较保守,但其表达具有时空特异性;在烟草叶片特异高表达的NtCOMT家族基因,对烟草木质素含量的分子调控具有潜在应用价值。
        In order to study the molecular regulation mechanism of tobacco lignin biosynthesis and to provide low-harm tobacco leaves for the tobacco industry,20 NtCOMT genes of common tobacco were identified in the K326 genome of common tobacco in this study with bioinformatics analysis,and their sequence analysis,evolutionary tree construction,protein property analysis,expression profile analysis and other analysis studies were conducted.The results showed that most tobacco NtCOMT proteins contain about 360 amino acid residues with molecular weight ranging from 37 to 41 kDa.About half of the tobacco NtCOMT protein was located in the cytoplasm and half in the extracellular.the NtCOMTfamily members had relative conserved structures,but their expression pattern varied.The NtCOMT genes which were found to be specifically highly expressed in tobacco leaves,had important reference value for the molecular regulation of tobacco lignin content.

引文

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