缢蛏线粒体DNACOI基因序列变异及群体遗传结构分析

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• 作者：牛东红李家乐姜志勇
• 会议时间：2007-08-01
• 关键词：水产养殖 ; 缢蛏 ; 基因序列 ; 遗传结构 ; 线粒体DNA
• 作者单位：上海市水产大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海200090
• 母体文献：2007全国博士生学术论坛——海洋、水产领域论文集
• 会议名称：2007全国博士生学术论坛——海洋、水产领域
• 会议地点：青岛
• 主办单位：国务院学位办
• 语种：chi
• 分类号：S96;Q17

摘要

利用线粒体DNA细胞色素氧化酶亚基(COI)基因序列片段对江浙闵地区缢蛏野生群体(江苏射阳—WS、浙江象山—WX,福建霞浦—WP)和养殖群体(江苏射阳—CS、浙江象山—CX、福建漳湾—CZ)的遗传结构进行初步分析.以特异引物进行PCR扩增,经纯化、测序、同源序列比对获得长度为556bp的核苷酸序列,其中A+T含量为66.2%,显著高于G+C含量.在缢蛏六群体98个个体中共检测到了56个单倍型和66个核苷酸多态位点,多态位点比例为11.7%.野生群体的平均核苷酸差异数和核昔酸多样性指数略高于养殖群体,但是野生群体和养殖群体的单倍型多态性指数均大于0.9,其单倍型较为丰富.此外,六群体均有各自特有的单倍型,但只有野生射阳群体与其他群体无共享单倍型,具有鉴定该群体的特异碱基序列.遗传距离和聚类结果显示,养殖群体与野生象山群体和野生霞浦群体间亲缘关系较近.