基于皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)EST数据库的串联重复序列特征分析
- 出版年：2010
- 作者：袁泽轶；张琳琳；张国范
- 单位1：中国科学院海洋研究所
- 单位2：中国科学院研究生院
- 出生年：1981
- 学历：硕士研究生
- 语种：中文
- 作者关键词：皱纹盘鲍；EST；串联重复序列；SSR
- 起始页：59
- 总页数：6
- 经费资助：国家重点基础研究发展计划资助（973计划项目，2010CB126401）：国家公益性行业（农业）科研专项资助(nyhyzx07-047)
- 刊名：海洋通报
- 是否内版：否
- 刊频：双月刊
- 创刊时间：1982
- 主管单位：国家海洋局
- 主办单位：国家海洋信息中心 国家海洋局北海分局 国家海洋局东海分局 国家海洋局南海分局
- 主编：徐胜
- 电子信箱：hytb@mail.nmdis.gov.cn
- 卷：29
- 期：1
- 期刊索取号：P226.06449-12
- 核心期刊：中文核心期刊；中国科技核心期刊；中国自然科学核心期刊
摘要
皱纹盘鲍大规模EST的分析研究较少，为了研究其基因组转录本的基本特征并为皱纹盘鲍中开发EST-SSR功能性标记奠定基础，我们利用生物信息学手段对NCBI公共数据库中的5 784条皱纹盘鲍EST序列进行EST-SSR特征分析。分析结果表明：(1)皱纹盘鲍EST中串联重复序列类型丰富；(2)皱纹盘鲍EST Gene Ontology注释序列SSR类型单一；(3)皱纹盘鲍EST-SSR分布广泛富，是EST-SSR标记开发的优良资源。