斜带石斑鱼脂肪酸去饱和酶和延长酶基因全长cDNA序列的克隆与分析
- 出版年：2009
- 作者：李观贵；梁旭方；何珊；郁颖；陈晓艳；黄柏炎；程龙球
- 单位1：暨南大学生命科学技术学院
- 出生年：1983
- 学历：硕士研究生
- 语种：中文
- 作者关键词：脂肪酸去饱和酶；脂肪酸延长酶；基因克隆；斜带石斑鱼Epinephelus coioides
- 起始页：95
- 总页数：8
- 经费资助：国家科技部863项目(2007AA092437)；国家自然科学基金项目(30670367)；广东省科技计划项目(2005820301005)；广东省自然科学基金项目(031886)
- 刊名：热带海洋学报
- 是否内版：否
- 刊频：双月刊
- 创刊时间：1982
- 主管单位：中国科学院
- 主办单位：中国科学院南海海洋研究所
- 主编：张偲
- 地址：广州市新港西路164号
- 邮编：510301
- 电子信箱：jto@scsio.ac.cn
- 网址：http：//jto@scsio.ac.cn；http：//www.jto.ac.cn
- 卷：28
- 期：6
- 期刊索取号：P226.06 842
摘要
利用逆转录聚合酶链式反应(reverse transcripLion polymerase chain reaction，RT-PCR)和cDNA末端快速扩增(rapid-amplification of cDNA ends，RACE)方法获得斜带石斑鱼Epinephelus coioides肝脏中控制高不饱和脂肪酸合成的脂肪酸去饱和酶(fatty acid desaturase，FAD)和脂肪酸延长酶(fatty acid elongase，ELO)基因的全长cDNA序列。结果表明，FAD基因的全长cDNA序列长1979 bp，含1338 bp的开放阅读框(open reading frame，ORF)，编码445个氨基酸。编码的蛋白序列含有FAD全部的特征结构区，包括3个组氨酸簇、2个跨膜区和1个细胞色素b5结构域，与金头鲷Sparus aurata、大麻哈鱼Oacorhvnchus keta、鲤鱼Cyprinus carpio和斑马鱼Danio rerio FAD的氨基酸同源性为66.5%-90.8%。二级结构分析显示其以螺旋和β折叠为主，系统进化分析表明其与金头鲷和欧洲鲈鱼的亲缘关系最近。ELO基因的全长cDNA序列1228 bp，含有885 bp的开放阅读框，编码294个氨基酸。该蛋白序列含有单一的氧化还原中心组氨酸簇、内质网停留信号和多个跨膜区等ELO特征结构区，与金头鲷、大麻哈鱼、尼罗罗非鱼Oreochromis niloticus和斑马鱼ELO的氨基酸同源性为71.1%-85.7%。蛋白二级结构预测表明其含有丰富的螺旋和6折叠结构，系统树分析显示其与金头鲷亲缘关系最近。斜带石斑鱼FAD和ELO全长cDNA序列的获得，为今后进一步研究其高不饱和脂肪酸合成途径奠定基础。