大菱鲆钙激活型钾离子通道基因TSKCα的克隆和序列分析
- 出版年：2008
- 作者：韩光；丛柏林；黄晓航；刘胜浩；刘晨临；林学政
- 单位1：国家海洋局第一海洋研究所
- 单位2：海洋生物活性物质国家海洋局重点实验室
- 出生年：1983
- 学历：硕士
- 语种：中文
- 作者关键词：钙激活；钾离子通道；大菱鲆；基因克隆
- 起始页：207
- 总页数：7
- 经费资助：国家自然科学基金项目——海洋鱼类细胞胞吐和分泌作用的分子调控(40476060)
- 刊名：海洋科学进展
- 是否内版：否
- 刊频：季刊
- 创刊时间：1983
- 主办单位：中国海洋学会；国家海洋局第一海洋研究所
- 主编：袁业立
- 地址：青岛市高新技术区仙霞岭路6号
- 邮编：266061
- 电子信箱：hbhh@chinajournal.net.cn
- 卷：26
- 期：2
- 期刊索取号：P226.067627
- 数据库收录：《中国核心期刊（遴选）数据库》收录期刊；《中文科技期刊数据库（全文版）》收录期刊；《中国期刊全文数据库》全文收录期刊；《中国学术期刊（光盘版）》全文收录期刊；《中国生物学文献数据库》收录期刊；《中国生物学文摘》收录期刊；
- 核心期刊：《中文核心期刊要目总览》核心期刊；中国科技核心期刊；《中国核心期刊（遴选）数据库》收录期刊；中国自然科学核心期刊；中文核心期刊
摘要
钙激活型钾离子通道蛋白(KCa)是位于细胞膜表面调节细胞功能的一类膜蛋白。通过设计特异性引物，以我国海水养殖大菱鲆（Scophthalmus maximus L.）血液cDNA为模板，利用RT-PCR技术克隆获得了一条基因片段。生物信息学分析证实该片段来自钙激活型钾离子通道基因SKCa（小电导钙激活型钾通道）家族。设计巢式PCR引物，通过5′RACE和3′RACE分别克隆得到了该基因的5′端序列和3′端序列。使用生物学软件拼接3段序列得到了大菱鲆钙激活型钾离子通道TSKCa基因的全长序列。TSKCa基因cDNA全长为1698bp，其中开放阅读框长度为1632bp，编码的TSKCa蛋白有544个氨基酸。比对TSKCa蛋白与GenBank中已有的SKCa蛋白序列，证实其序列同源性很高。使用网络DAS和srsbin服务器对TSKCa蛋白进行跨膜结构预测和疏水性分析，并结合已有的研究结果推测TSKCa蛋白的结构由S1～S6六个跨膜结构域和一个孔道区（P区）组成。