湖泊沉积物中DNA提取与PCR扩增

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• 责任者：申慧彦^c中国科学院南京地理与湖泊研究所湖泊与环境国家重点实验室^d1978^e博士研究生 ; 李世杰
• 刊名：地球科学进展
• 出版年：2008
• 卷期：23^b4总160
• 关键词：湖泊沉积物20^a藻类 ; 生态系统30^a微囊藻 ; DNA提取 ; PCR扩增
• 页码：433～438
• 索书号：P206/208-147
• 图表：^c表1参26插图
• 分类号：0630
• 文摘期号：2008/09

摘要

对湖泊沉积物中保存的生物大分子——DNA进行研究分析,以探讨湖泊生态系统随环境改变而演变的过程。根据前人对土壤和海洋沉积物DNA的提取方法,针对湖泊沉积物的特点进行改进,在此基础上对太湖梅梁湾湖泊沉积岩芯进行DNA提取和扩增。结果表明:不同深度湖泊沉积物均能获得DNA,且纯度较高,OD₂₆₀/OD₂₈₀均大于1.4、OD₂₆₀/OD₂₃₀大于1.1,可直接用于PCR(polymerase chain reaction)扩增。对微囊藻的16S rRNA基因进行PCR扩增,结果发现在前5个沉积物样品中,均得到了200 bp左右的微囊藻16S rRNA基因片段,表明微囊藻或已降解的微囊藻基因片段存在于这5个层位的湖泊沉积物中。这为利用湖泊沉积物中的生物分子来推断历史湖泊生物群落结构,判断湖泊生态演变的历史提供了新的研究思路。